La independencia del Athletic Club de Madrid llegó en 1921. En 1923 inauguró el estadio Metropolitano y en 1928 participó, junto a su pariente del norte y otros grandes del fútbol español, nueva camiseta de la real sociedad en la creación de la Liga. La primera victoria como local llegó en la quinta jornada, el 10 de marzo de 1929, cuando el Athletic goleó por 4-1 al Barcelona con dos goles de Cosme y otros dos de Illera. 100 goles en la competición. Málaga, en cuya final se impuso el Athletic de Bilbao al Sevilla Fútbol Club por cuatro goles a cero. Se unió al Club Deportivo Basconia, segundo filial del club, en el año 2002. En 2004 dio el salto al Bilbao Athletic, donde pasó dos temporadas.
En 1915 de una escisión del Football Club Malagueño, nacido en 1912, surge un segundo Málaga Football Club, y desde ese momento se origina una gran rivalidad entre ambos equipos y aficiones, los malaguistas frente a los malagueñistas. Aun así, en la Copa del Rey realiza una digna actuación, eliminando a la Real Sociedad en la 2.ª eliminatoria y después al Córdoba. 86′ Remate fallado por Mikel Merino (Real Sociedad) remate de cabeza desde el centro del área que se pierde por la izquierda. En esta primera etapa en Primera División, el Málaga permaneció por dos temporadas consecutivas en la élite del fútbol español, con el mítico ex-jugador Ricardo Zamora ocupando el banquillo de La Rosaleda. En la temporada 1980/81, es nombrado presidente el señor Antonio Pérez-Gascón Cobos y con él llega al banquillo Antonio Fernández Benítez.
El 10 de julio de 2013 se hizo oficial su fichaje con la UD Las Palmas para disputar la temporada 2013/14 en Segunda División. ↑ Agencia EFE (13 de julio de 2012). «Jordi Alba entra en la lista oficial de la selección olímpica española». ↑ «La S.D. Eibar vestirá Hummel la próxima temporada». ↑ «La Roja», «La Furia Española», «La Furia Roja», «La Furia» son seudónimos. ↑ Mascaró, Lluís (6 de junio de 2015). «El Barça gana su quinta Champions y logra su segundo triplete». En el partido de vuelta en La Rosaleda, jugado el 16 de junio de 1990, el Málaga logró igualar la eliminatoria y forzar la prórroga con gol de José Antonio Rivas.
Con el club de vuelta en la Segunda División y manteniendo un balance económico maltrecho, se avecinaba una aciaga época en la categoría de plata que había comenzado con el abandono de Pérez-Gascón de su cargo presidencial. Tras una derrota ante el Real Murcia en La Rosaleda al comienzo de la segunda vuelta y siete jornadas sin conocer la victoria, Luis Costa es destituido de su cargo y se decide que su puesto lo ocupe Antonio Benítez. El 21 de abril de 1985, el Málaga se enfrentó al Real Betis en La Rosaleda empatando a uno. Malagueño y Málaga S.C. Malagueño obtendría dos sonadas victorias sobre el Real Club Deportivo Español de Barcelona, los días 16 y 17 de agosto, cuando contaba el equipo catalán entre sus filas con el legendario Ricardo Zamora, que más tarde sería entrenador del C.D. Toma este nombre del vecino Asilo de San Mamés, al que pertenecían los terrenos sobre los que posteriormente se levantó el estadio.
Este año, la Premier League destaca por la sobriedad de los diseños de sus principales equipos y por dos cambios de proveedor en dos de los punteros. Nada hacía presagiar que en la temporada 1983/84 esa misma plantilla, sin excesivos cambios en la misma, camisetas futbol podría llegar a tener un rendimiento tan diferente y cuanto menos superior. De parecida forma se desarrolló la temporada siguiente (1964-65) con Román Galarraga al frente. Tras la temporada de su descenso, el Arenas cuajó una buena campaña en la Segunda División de España 1935/36. Rozó el ascenso, pero se le escapó en la última jornada de Liga al perder frente al Murcia FC. Málaga durante su primera temporada en primera división.